Адаптация одноимённой браузерной карточной игры «Kantai Collection». Действия фильма происходят в альтернативной вселенной и разворачиваются вокруг нескольких девочек. Их зовут Фубуки, Юдачи и Муцуки, и они являются духами военных кораблей и субмарин времён Второй мировой войны. Однажды на землю из глубин морей и океанов вторгаются неизвестные враги, прозвавшие себя «Флотом глубокого моря». Бо́льшая часть водных территорий уже и так принадлежит им, но они заявляют о своём намерении захватить и сушу.