После разрушительного военного конфликта мировые правительства решили использовать более изощренные тактики достижения своих целей, например, войны в тени. Лили — студентка одного из многочисленных учебных заведений для юных шпионов. К сожалению, несмотря на хорошие результаты на письменных экзаменах, ей с трудом удается пройти практику. Не имея никаких навыков работы, она и не надеется окончить университет. Но вдруг ей предлагают присоединиться к таинственной команде ""Томошиби"" и принять участие в невыполнимой миссии. Воодушевленная Лили с энтузиазмом соглашается. Однако потом выясняется истинная цель этой организации и безнадежное положение главной героини. Теперь вместе с другими беглянками и способным таинственным молодым человеком, возглавляющим операцию, Лили придётся противостоять очень опасному врагу.